С 1999 г. в институте действует аспирантура, профессорско-преподавательский которой укомплектован из ученых Учреждения. В настоящее время на основании лицензии на право ведения образовательной деятельности в сфере профессионального образования от 11.01.2017 № 2515 и свидетельства об аккредитации от 01.02.2016 № 1647, выданные Федеральной службой по надзору в сфере образования и науки обучение аспирантов осуществляется по направлениям: 35.06.04 Технологии, средства механизации и энергетическое оборудование в сельском, лесном и рыбном хозяйстве (по специальности 05.20.01 – технологии и средства механизации сельского хозяйства); 38.06.01 Экономика  (по специальности 08.00.05 Экономика и управление народным хозяйством).

Открытие аспирантуры обеспечило возможность целенаправленно подбирать и готовить собственные научные кадры в области информационного обеспечения инновационного развития АПК. За период существования аспирантуры в учреждении ее окончили 56 человек. 9 аспирантов и 2 соискателя (20%) защитили кандидатские диссертации, из которых 7 являлись работниками учреждения. Также сотрудниками учреждения в качестве соискательства были защищены 3 докторские диссертации. 16 человек закончивших и обучающихся в аспирантуре, работают в учреждении и по настоящее время.

Созданы две научные школы: «Научно-информационное обеспечение инновационного развития сельского хозяйства», руководитель -
Федоренко Вячеслав Филиппович, акад. РАН, д-р техн. наук, проф., директор (подготовлено два доктора и пять кандидатов наук); «Технологии и средства технического сервиса сельскохозяйственной техники», руководитель - Голубев Иван Григорьевич, д-р техн. наук, проф., зав. отделом (подготовлено шесть кандидатов наук).